Kard. Stanisław Dziwisz odprawił w Kaplicy Kapłańskiej sanktuarium św. Jana Pawła II Mszę św. w 14. rocznicę jego śmierci. W Kaplicy Kapłańskiej znajduje się płyta nagrobna polskiego papieża z Grot Watykańskich.
Kard. Stanisław Dziwisz poświęcił w papieskim sanktuarium na
Białych Morzach trzy kaplice, zbudowane na wzór bazylik Zwiastowania, Bożego Narodzenia
oraz Grobu Bożego w Ziemi Świętej.