Kwestia komunii kościelnej stała w centrum papieskiego przesłania do biskupów Portugalii. Wspólnym spotkaniem z Benedyktem XVI zakończyli oni wizytę „ad limina Apostolorum".
W przesłaniu do portugalskich biskupów Benedykt XVI przypomniał nowy impuls, jaki tamtejszemu Kościołowi dały obchody Wielkiego Jubileuszu roku 2000. Wymienił w tym kontekście liczne inicjatywy, jak ożywienie kultu Eucharystii, odnowienie praktyki Mszy niedzielnej, czy krajowe spotkanie ruchów kościelnych i kongres rodzin katolickich. Znaczącym momentem były też uroczystości beatyfikacyjne. Papież zachęcił, aby te wydarzenia stanowiły punkt oparcia dla prawdziwych przemian w Kościele w duchu Soboru Watykańskiego II.
Chodzi zwłaszcza o należyte rozumienie roli duchowieństwa i świeckich oraz o ich wzajemną więź w pełnieniu właściwej im misji. Ta komunia powinna być zakorzeniona w umiłowaniu Jezusa Chrystusa. Jest to konieczne w sytuacji rosnącej laicyzacji społeczeństwa portugalskiego, gdzie katolikom potrzeba zapewnić odpowiednią formację religijną, wspartą świadectwem wspólnoty wierzących. Nawiązując do kończących się obchodów 90-lecia objawień fatimskich Ojciec Święty życzył portugalskiemu Kościołowi, by czerpał wzór z Maryi, która uczy nawet maluczkich odwiecznych prawd oraz modlitwy, wiary i miłości.
W czasie pobytu w Rzymie episkopat Portugalii odbył m.in. sesję plenarną. Podczas obrad poruszono problem relacji Kościół-państwo w związku z sugestiami rządzących w Portugalii socjalistów co do ewentualnej renegocjacji konkordatu.
W tle afery z tzw. bankiem watykańskim jest pranie brudnych pieniędzy.
Punkt medyczny, gdzie prowadzone są szczepienia, urządzono w atrium watykańskiej Auli Pawła VI.
„Chrześcijanie innych wyznań, z ich tradycjami, z ich historią, są darami Boga".